Как и по всей стране, геморрагическая лихорадка с почечным синдромом занимает одно из первых мест по заболеваемости среди природно-очаговых инфекционных заболеваний.
Природные очаги зарегистрированы в 9 городах и 27 районах, в 227 населённых пунктах.
Выделяют 5 наиболее активных природных очагов, которые приурочены к широколиственных пойменным лесам: Бузулукский боровой, Бугурусланский лесной, Залаирско-Сакмарский пойменно-лесной, Ташлинский и Илекский очаги.